農村土地承包經(jīng)營權登記后的權屬爭議時有發(fā)生，一般存在兩個階段四種情況，各階段的確權處理主體不同。

一、登記確權

在這個階段，可能會遇到兩個問題：“登記錯誤”和“未實際取得土地承包經(jīng)營權”（雖然登記了但沒真正拿到地）。

2018年第二次修正的《農村土地承包法》第二十四條：“國家對耕地、林地和草地等實行統(tǒng)一登記”，即確權登記是由國家統(tǒng)一進行。

《中華人民共和國農村土地承包經(jīng)營權證管理辦法》第十條規(guī)定：“農村土地承包經(jīng)營權證登記簿、承包合同登記及其他登記材料，由縣級以上地方農業(yè)行政主管部門管理?！?/span>

因此，現(xiàn)土地承包經(jīng)營權確權機關包括縣級以上地方人民政府農業(yè)農村、林業(yè)和草原等主管部門。 

登記確權中容易發(fā)生糾紛的二種情形：

1，登記錯了怎么辦？

如果發(fā)現(xiàn)登記錯了，比如證上寫的和實際不一樣，你可以向鄉(xiāng)（鎮(zhèn)）政府的農村經(jīng)營管理部門提出更正申請，讓他們幫忙改過來。

2，沒真正拿到地怎么辦？

如果你明明登記了卻沒拿到地，這事兒不能直接去法院打官司。你得先去找相關的行政主管部門申請，讓他們幫你解決。如果硬要去法院，法院可能會告訴你：“這不是我們管的，你得找政府部門?！?/span>

根據(jù)《最高人民法院關于審理涉及農村土地承包糾紛案件適用法律問題的解釋》：同一農村土地承包戶內成員因未實際取得土地承包經(jīng)營權提起民事訴訟的，法院應當告知其向有關行政主管部門申請解決；堅持訴訟的，依法裁定駁回起訴。

二、權屬爭議階段

這個階段主要是“一地二包”（一地給了兩家）或者“權屬糾紛”的問題。

關于土地承包權的爭議，不屬于行政糾紛、不是行政案件，鎮(zhèn)政府無權確權，而是屬于合同糾紛、民事案件。政府不能直接說了算，因為它不屬于政府要先處理的土地確權案件。如果政府硬要插手，那就是越權了。

《土地權屬爭議調查處理辦法》第十四條規(guī)定，農村土地承包經(jīng)營權爭議案件不屬于土地權屬爭議受案范圍，不屬于由人民政府先行處理的土地確權案件的受案范圍。人民政府將農村土地承包經(jīng)營權爭議作為土地確權案件作出確權處理決定的，屬于超越職權的違法行政行為。

雖然無法進行行政訴訟，但這些爭議其實是合同糾紛，屬于民事案件。你可以：

①協(xié)商解決；

②或請求調解；

③或農村土地承包仲裁機構申請仲裁；

④或直接向人民法院提起民事訴訟。

兩種常見的權屬爭議情況：

1，“一地二包”：就是同一塊地給了兩家承包，這時候要看合同，誰的合同有效就聽誰的。

2，“權屬糾紛”：它是前后兩個土地承包合同的效力、當事人之間的權屬糾紛問題，當事人可以：

①要求發(fā)包人（村集體經(jīng)濟組織）協(xié)調解決；

②或通過仲裁或民事訴訟的途徑確定合同的效力，以合同的效力確定權屬的歸屬，此時農村土地承包經(jīng)營權權屬的歸屬就由法院來確定。